Ambas as formas estão corretas.

No entanto o significado é ligeiramente distinto.

As flores têm sua beleza: Indica que todas as flores têm uma beleza inerente. Vê-se assim que a beleza das flores é uma característica comum a todas as flores (sendo beleza um substantivo abstrato). Não é a mesma coisa que dizer os homens têm seu carro (que significa que todos os homens deste contexto possuem um carro que pertence a um terceiro), mas sim "os homens têm sua masculinidade" ou "os macacos têm sua esperteza".

As flores têm suas belezas: É parecido com a primeira forma, porém neste caso as flores têm mais de uma forma de beleza. Outro exemplo que ilustra isso seria "as obras de arte têm suas interpretações".

Ambas as formas estão corretas.

No entanto o significado é ligeiramente distinto.

As flores têm sua beleza: Indica que todas as flores têm uma beleza típica. Vê-se assim que a beleza das flores é uma característica comum a todas as flores (sendo beleza um substantivo abstrato). Não é a mesma coisa que dizer os homens têm seu carro (que significa que todos os homens deste contexto possuem um carro que pertence a um terceiro), mas sim "os homens têm sua masculinidade" ou "os macacos têm sua esperteza".

As flores têm suas belezas: É parecido com a primeira forma, porém neste caso as flores têm mais de uma forma de beleza. Outro exemplo que ilustra isso seria "as obras de arte têm suas interpretações".