Por que é que em palavras como li.mão, a.ma.nhã, co.me.rão, etc, a última sílaba é a sílaba tónica?
Este é um daqueles casos em que as palavras são agudas, mesmo sem acento? Como por exemplo, a.nel, co.zi.nhar, ou cha.fa.riz?
Resposta curta (TL;DR): link
O til não tem influência sobre qual a sílaba tónica... mas normalmente a sílaba tónica coincide com a que tem o til.
(Ênfase minha. Retirado da resposta aceitada.)